Dévoilement d'Omicron : sera-t-il le dernier variant du coronavirus à faire des ravages dans le monde ?

Écrit par : Zhu Hengheng

Rédacteur en chef : Wang Haha

Mise en page : Li Xuewei

En 2021, la situation mondiale liée au COVID-19 reste sombre. La souche Delta continue de ravager le monde. Le nombre cumulé de cas confirmés continue d’augmenter, dépassant les 300 millions à ce jour, et le nombre de morts a déjà dépassé les 5 millions. Pour la Chine, qui applique strictement la stratégie de zéro dédouanement, la situation actuelle en matière de prévention de l’épidémie n’est pas optimiste. Des épidémies à petite échelle ont éclaté dans de nombreuses provinces et villes du pays. Le nombre de nouveaux cas par jour au Shaanxi a déjà dépassé les trois chiffres, et au Henan, il a également atteint les deux chiffres.

Début 2022, l’épidémie dans le Shaanxi et le Henan n’était pas encore terminée et Tianjin avait le premier lot de cas locaux d’Omicron dans mon pays. Dans cette vague d'épidémie à Tianjin, les deux premiers cas locaux ont été confirmés parmi des personnes qui ont activement recherché un traitement médical au petit matin du 8 janvier. Le séquençage complet du génome du nouveau coronavirus a confirmé qu'ils étaient infectés par la variante Omicron. Lors du dépistage à grande échelle qui a suivi, 20 nouveaux cas confirmés ont été découverts.

(Source : CCTV.com)

En outre, selon les dernières nouvelles du Bureau de commandement de la prévention et du contrôle du COVID-19 d'Anyang dans la province du Henan, des cas d'infection par Omicron à Tianjin se sont propagés à Anyang. Après le séquençage du génome entier des virus de deux patients locaux de la ville d'Anyang par le Centre provincial de contrôle et de prévention des maladies du Henan, il a été découvert que ces deux patients appartenaient à la même chaîne de transmission que l'épidémie de Tianjin.

À l'approche de la Fête du Printemps et de la tenue des Jeux olympiques d'hiver, les mouvements de population à grande échelle dans le pays auront forcément un impact sur la prévention et le contrôle de l'épidémie en Chine. L’émergence de la souche Omicron, dotée d’une capacité de transmission plus forte, en Chine augmentera sans aucun doute encore la difficulté de la prévention et du contrôle de l’épidémie. Par conséquent, afin de mieux prévenir et contrôler la nouvelle épidémie de coronavirus, nous devons avoir une compréhension claire de la variante Omicron.

1. Origine d'Omicron

Le 24 novembre 2021, l’Afrique du Sud a signalé un nouveau variant du coronavirus, le B.1.1.529. Le 26 novembre, l’Organisation mondiale de la santé a tenu une réunion d’urgence, a classé ce nouveau variant comme variant préoccupant et l’a nommé Omicron.

Par la suite, Omicron a commencé à se propager dans le monde entier, remplaçant la variante Delta précédente et devenant la nouvelle variante de coronavirus la plus courante au monde. Prenons l’exemple des États-Unis, qui comptent le plus grand nombre de cas au monde : depuis la découverte du premier cas d’Omicron le 1er décembre, en moins de trois semaines, le 18 décembre, les infections à Omicron représentaient plus de 70 % des nouveaux cas d’infection quotidiens.

Cependant, bien que le premier cas d'infection par Omicron ait été confirmé en Afrique du Sud, les scientifiques ne savent toujours pas quand et où cette variante est apparue jusqu'à présent.

(Source : Muaz Kory/Al Jazeera)

Actuellement, les scientifiques ont deux explications principales sur l’origine d’Omicron. La première explication est que lorsqu'une personne atteinte du sida ou d'une immunodéficience sévère est infectée par le nouveau coronavirus, le virus ne peut pas être complètement éliminé, il est donc capable de se reproduire et d'évoluer de génération en génération dans le corps du patient. Ce processus est très long, peut-être plus de 300 jours, et conduit finalement à l’émergence du variant Omicron.

Il convient de noter qu’il existe actuellement des dizaines de millions de patients atteints du SIDA et d’immunodéficience dans le monde qui doivent prendre des médicaments immunosuppresseurs. Donc, dans cette théorie, nous devons mieux protéger les personnes immunodéprimées, les aider à se faire vacciner, leur fournir un traitement, afin que le nouveau coronavirus ne mute pas davantage.

La deuxième explication est que le nouveau coronavirus est similaire au virus de la grippe et est un virus zoonotique. Alors que le nouveau coronavirus se propageait au sein de la population humaine, il a également survécu et s’est multiplié dans un hôte intermédiaire, un certain animal, et a finalement évolué vers la variante Omicron. Nous savons tous que la grippe aviaire est un type de virus de la grippe qui se multiplie et évolue dans le corps d’un animal depuis longtemps, se transformant en une variante dotée d’une capacité de transmission extrêmement forte, qui finit par ravager le monde et infecter d’innombrables patients.

Bien que la deuxième explication ait reçu moins d’attention que la première, il existe actuellement des études qui soutiennent la possibilité de la deuxième explication. Bien sûr, les scientifiques ne savent toujours pas quelle explication est la plus probable. Mais il ne fait aucun doute que par rapport à la première explication, si la deuxième explication est vraie, alors la pression sur les humains pour prévenir et contrôler la nouvelle épidémie de la couronne sera considérablement accrue, et peut-être qu'à l'avenir, elle coexistera vraiment avec les humains pendant longtemps comme la grippe.

2. En quoi est-il différent des variantes précédentes du coronavirus ?

Comme nous le savons tous, le nouveau coronavirus utilise principalement la protéine de pointe pour infecter les cellules humaines, et le système immunitaire élimine également le nouveau coronavirus en reconnaissant la protéine de pointe. Par rapport à la variante Delta, la protéine de pointe de la variante Omicron présente 35 nouvelles mutations génétiques, et ces mutations sont étroitement liées à une entrée plus efficace dans les cellules, échappant au système immunitaire et améliorant l'infectiosité.

Par conséquent, malgré l’émergence de nombreuses nouvelles recherches, il est presque certain que le variant Omicron est 2 à 3 fois plus contagieux que le variant Delta. Dans le même temps, la capacité préventive des vaccins administrés précédemment contre Omicron sera également réduite. Cependant, le vaccin peut encore réduire l’incidence de complications graves après une infection par Omicron.

Prenons l’exemple du vaccin de Pfizer : des études antérieures ont montré que deux doses du vaccin peuvent réduire de 70 % les complications graves et l’hospitalisation, mais en laboratoire, il ne peut offrir qu’une protection de 33 % contre l’infection. D’autres études ont montré que les injections de rappel peuvent réduire de 75 % le risque de complications graves liées à Omicron. Une autre étude non évaluée par des pairs a montré que l’immunité induite chez les patients précédemment infectés par le nouveau coronavirus ne protégeait pas contre l’infection par Omicron, mais les personnes ayant reçu au moins une dose du vaccin à ARNm étaient toujours protégées contre l’infection par Omicron.

(Source : pixabay)

Cela signifie également que même si le système de vaccination existant résiste difficilement à l’impact d’Omicron, il peut néanmoins prévenir de graves complications dans les groupes à haut risque, et la vaccination active reste très nécessaire.

Cependant, à l’heure actuelle, il existe très peu de données sur la gravité de la maladie suite à une infection par Omicron par rapport à d’autres variants.

Théoriquement, le nouveau coronavirus peut pénétrer dans le corps humain de deux manières. L'une d'elles consiste à se lier à la protéine réceptrice ACE2 à la surface cellulaire, puis une autre protéine appelée TMPRSS2 coupe la protéine de pointe, et les particules virales fusionnent avec les cellules pour infecter les cellules. L’autre est que le nouveau coronavirus se lie à la protéine ACE2 à la surface de la cellule et pénètre dans la cellule par endocytose, traverse la vésicule grâce aux protéases tissulaires, pénètre dans le cytoplasme et infecte la cellule.

Les premières études ont montré que TMPRSS2 clive la protéine de pointe d’Omicron moins efficacement que d’autres variantes. Entre-temps, certaines études pré-imprimées ont montré que les médicaments chimiques qui bloquent TMPRSS2 peuvent inhiber les variantes Alpha ou Delta, mais pas la variante Omicron. En revanche, l’inhibition des cathepsines à l’aide de médicaments chimiques inhibe l’oméprazole mais pas les variantes alpha ou delta. Étant donné que le gène TMPRSS2 est plus fréquent dans les cellules des voies respiratoires inférieures, certains experts pensent que l’infection par Omicron pourrait être moins dommageable pour les poumons que d’autres variantes.

Outre les données théoriques, certains rapports de cas provenant d’Afrique du Sud montrent également que les symptômes après une infection par Omicron sont plus légers que ceux de la variante Delta. Cependant, la gravité de la maladie après une infection par le nouveau coronavirus est étroitement liée à l’âge du patient. La plupart des personnes infectées par Omicron sont des jeunes, ce qui peut facilement prêter à confusion.

De plus, il existe des preuves qu’Omicron peut provoquer une déshydratation sévère en provoquant de la fièvre, des vomissements et de la diarrhée, et peut aggraver la gravité d’autres maladies chroniques sous-jacentes, telles que le diabète.

Dans l’ensemble, il n’existe actuellement aucune preuve qu’Omicron provoque une maladie plus grave, mais on ne peut pas simplement supposer qu’il est moins pathogène.

3. Omicron sera-t-il le dernier variant du coronavirus à faire des ravages dans le monde ?

Selon le professeur Aris Katzourakis de l’Université d’Oxford, qui se concentre sur l’évolution virale, Omicron pourrait ne pas être le dernier variant inquiétant du coronavirus.

Après tout, Omicron s’est séparé très tôt du spectre viral et a évolué de manière indépendante. À l’avenir, davantage de variants dotés à la fois de capacités d’échappement immunitaire et de fortes capacités de transmission d’Omicron pourraient apparaître, et les nouveaux variants pourraient être plus toxiques qu’Omicron.

(Source : pixabay)

Actuellement, l’Organisation mondiale de la santé suit deux « variants d’intérêt » et trois « variants sous surveillance » ainsi que 30 sous-lignées de la souche Delta.

Cependant, certains experts estiment que l’émergence d’Omicron pourrait être bénéfique pour l’immunité collective. Après tout, la vaccination et l’infection naturelle ont exposé des millions de personnes aux premières protéines de pointe du coronavirus et ont formé une barrière immunitaire contre elles. L'épidémie à grande échelle d'Omicron pourrait encore renforcer et étendre l'immunité du corps humain, formant une barrière immunitaire plus forte, réduisant ainsi la menace de nouvelles variantes à l'avenir.

Références :

https://www.science.org/content/article/omicron-cases-are-exploding-scientists-still-don-t-know-how-bad-wave-will-be

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2787065?resultClick=1

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2787609?resultClick=1

Les manchettes académiques