The Lancet : Premier cas d'infection humaine par le COVID-19 par un animal de compagnie

Le 11 mars, une étude publiée dans la revue médicale internationale The Lancet par des chercheurs de l'Université de Hong Kong a révélé que les hamsters syriens peuvent être naturellement infectés par le virus Delta, qui peut ensuite infecter les humains. C'est la première fois au monde qu'il est confirmé que des hamsters syriens de compagnie sont capables de transmettre le nouveau coronavirus à l'homme.

C’est une étude très choquante. On peut dire qu’il s’agit du premier cas d’infection d’un humain par un animal de compagnie. Cela soulève également de nouvelles réflexions sur notre prévention des épidémies.

Par exemple, les propriétaires d’animaux de compagnie devraient prendre certaines mesures de protection pour leurs animaux et éviter de les laisser sortir pendant l’épidémie ; par exemple, de nombreux enfants aiment toucher les animaux domestiques à l’extérieur, ils doivent donc également y prêter une attention particulière ; Pour prendre un autre exemple, le commerce des animaux de compagnie est un commerce mobile mondial de grande envergure, et la prévention doit être renforcée.

Ensuite, nous discutons de cet article en détail.

01. Le nouveau coronavirus s’est-il propagé des humains à d’autres animaux, ou des animaux aux humains ?

Bien que le nouveau coronavirus se soit largement propagé entre les humains et les animaux, de nombreuses études ont également révélé que les animaux de compagnie peuvent également être porteurs du nouveau coronavirus. Cependant, les gens ont toujours cru que les propriétaires étaient infectés par le nouveau coronavirus et le transmettaient à leurs animaux de compagnie, mais il n’y a eu aucun rapport d’animaux de compagnie le transmettant aux humains.

Récemment, The Lancet a publié une étude intitulée « Transmission du variant delta du SARS-CoV-2 (AY.127) des hamsters de compagnie aux humains, conduisant à une transmission interhumaine : une étude de cas »

Dans cette étude, des hamsters de compagnie ont transmis le nouveau coronavirus (variante delta du SARS-CoV-2 (AY.127)) à leurs propriétaires, ce qui a conduit à une transmission interhumaine.

En fait, de nombreux reportages font état de personnes transmettant le nouveau coronavirus aux animaux. Par exemple, des tigres et des gorilles dans des zoos ont été infectés par le nouveau coronavirus, transmis par les humains.

Mais les animaux peuvent-ils transmettre le nouveau coronavirus aux humains ?

Bien que de nombreux chercheurs pensent que la charge d’infection par la COVID-19 chez les animaux est faible et que la COVID-19 est plus susceptible d’être transmise aux humains, les preuves sont insuffisantes. Bien sûr, on pensait auparavant que les visons d’élevage pouvaient être infectés par le nouveau coronavirus et le transmettre aux humains, c’est pourquoi l’abattage des visons a eu lieu.

Cependant, en réalité, si l’on considère un fait fondamental : le nouveau coronavirus est d’abord venu des animaux, il est donc inévitable qu’il se propage des animaux aux humains.

Cependant, les preuves manquent ! En fait, de plus en plus de personnes pensent que le nouveau coronavirus a été transmis des animaux aux humains par « contamination », ce qui est similaire au contact avec des aliments congelés infectés par le nouveau coronavirus ou à la transmission par contact avec des objets.

Par conséquent, cette étude du Lancet est également assez représentative, des animaux aux humains, et il s’agit d’une infection.

02. Épidémie de COVID-19 dans une animalerie

Une épidémie soudaine d’infection au COVID-19 s’est produite dans une animalerie à Hong Kong. Les animaux de compagnie et les employés du magasin ont été infectés.

Cependant, ce qui est étrange, c'est que le virus qui prévalait à Hong Kong à cette époque était Omicron, mais le virus qui a infecté cette maison était Delta. Alors comment expliquer l’infection dans cette animalerie ?

Les chercheurs ont donc lancé une enquête à grande échelle sur les animaleries.

Ils ont testé le personnel de l'animalerie et les animaux de compagnie dans son entrepôt et ont découvert que les personnes et les animaux étaient infectés par le nouveau coronavirus. Il faut souligner ici qu’il s’agit d’une infection, c’est-à-dire que le virus pénètre dans l’organisme et commence à se multiplier, plutôt que d’être accidentellement contaminé par le virus. Ils ont déterminé cela en effectuant simultanément des tests oraux, anaux et sanguins.

Parmi eux, les hamsters présentent le taux d’infection le plus élevé.

Huit des 16 hamsters syriens (50 %) et sept des 12 hamsters syriens (58 %) de l'entrepôt correspondant étaient positifs à l'infection par le SRAS-CoV-2 par RT-qPCR ou par test sérologique.

Cependant, d'autres animaux de compagnie tels que les hamsters nains (n ​​= 75), les lapins (n ​​= 246), les cobayes (n = 66), les chinchillas (n = 116) et les souris (n = 2) étaient négatifs au test RT-qPCR.

03. Le virus se transmet-il de l’homme au rat ou du rat à l’homme ?

Alors, ce nouveau coronavirus a-t-il été transmis des humains aux hamsters ou des hamsters aux humains ? Le moment de l’infection chez les humains est certain, mais nous ne le savons pas pour les hamsters, car nous ne pouvons pas leur ouvrir la bouche pour leur demander quand ils ont été infectés. Sans compter qu’eux-mêmes ne le savent pas non plus. Même s’ils pouvaient parler, il est difficile de dire si les hamsters présentent des symptômes d’infection par le nouveau coronavirus.

À l’heure actuelle, nous ne pouvons compter que sur les méthodes bioinformatiques, c’est-à-dire le séquençage.

Ceci est différent de notre test d’acide nucléique. Notre test d’acide nucléique est considéré comme positif tant que ce fragment est détecté.

Le séquençage, quant à lui, consiste à découvrir la séquence complète du virus du début à la fin, exposant ainsi directement la véritable apparence du virus.

Les chercheurs ont donc utilisé la plateforme de séquençage ISeq d'Illumina pour tester les échantillons de COVID-19 collectés.

Comme prévu.

1. Les humains et les hamsters sont infectés par le même nouveau coronavirus

Je crois qu’après cette période, tout le monde a eu une compréhension approfondie du nouveau coronavirus. Par exemple, delta, omicron, etc., ce sont tous les mêmes virus, mais ils diffèrent par des mutations génétiques spécifiques, formant des branches évolutives indépendantes. Cette fois, les hamsters et les humains ont été infectés par la même souche mutante delta (AY.127).

2. Cette souche ne s’était pas propagée localement auparavant.

En combinaison avec des enquêtes épidémiologiques locales, il a été constaté que la souche mutante AY.127 était complètement nouvelle dans la région et n'était jamais apparue auparavant. Cela signifie que la souche était dans ce magasin, soit le commis, soit le hamster.

3. Le virus a été transmis aux humains par des hamsters

Je suppose que beaucoup de gens sont curieux en ce moment, n’y a-t-il pas de solution ? En fait, il existe encore une solution en bioinformatique. C'est-à-dire qu'en effectuant une analyse phylogénétique sur la séquence de son génome, nous pouvons vérifier l'ordre de l'évolution (tout comme nous voyons que les humains sont originaires d'Afrique, ce qui est la méthode utilisée).

Il a été constaté que bien que les hamsters et les humains aient été infectés par la même souche mutante, il existait des différences spécifiques

Analyse plus approfondie de l'arbre phylogénétique

Les résultats ont montré que, d’un point de vue phylogénétique, le virus est apparu en premier chez les hamsters, et plus tard chez les humains.

Plus précisément, les hamsters ont été infectés vers le 14 octobre 2021 (IC à 95 % du 15 septembre au 9 novembre 2021), et ce lot de hamsters a été importé de longue distance et est arrivé à l'animalerie le 22 décembre 2021, et les humains ont été infectés le 4 janvier 2022.

On peut dire qu’il s’agit d’un exemple très typique, à savoir que le nouveau coronavirus peut être transmis des animaux de compagnie aux humains et provoquer une infection supplémentaire dans la population.

04. La particularité et l'importance de cette étude

Je suppose que beaucoup de gens sont curieux. Cela fait trois ans que l’épidémie de COVID-19 a éclaté, et les animaux de compagnie ont eu de nombreux contacts avec les humains, et de nombreux cas d’infection d’animaux de compagnie ont été signalés. Pourquoi cette étude a-t-elle été la seule publiée dans The Lancet ? En fait, il est très difficile de prouver que les animaux domestiques peuvent infecter les humains.

Tout d’abord, la plupart des gens entrent en contact étroit avec leurs animaux de compagnie. Il est difficile de déterminer si ce sont les humains qui infectent les animaux de compagnie ou les animaux de compagnie qui infectent les humains. Par exemple, dans un cas d’infection d’un animal de compagnie signalé à Hong Kong, en raison de preuves insuffisantes, on ne peut que conclure que les humains ont infecté les animaux de compagnie.

Deuxièmement, la plupart des infections sont souvent causées par la même souche, tout comme la souche dominante actuelle dans le monde, Omicron. Dans ce cas, il est impossible de déterminer d’où proviennent les souches des animaux domestiques et des humains.

Ce qui est particulier dans cette étude du Lancet, c'est que la souche virale qui s'est déclarée à Hong Kong à cette époque était Omicron, mais celle qui est apparue dans cette animalerie était Delta. Il s’agit d’une source d’infection indépendante, qui mérite une attention particulière.

Troisièmement, il doit y avoir une différence de temps suffisante pour déterminer l’ordre.

Ce point est similaire au premier, c'est-à-dire que la grande majorité des infections sont concentrées sur une période et il est impossible d'en distinguer l'ordre.

Ce qui est particulier dans l’affaire Lancet, c’est qu’elle s’appuie sur une chronologie claire.

Vers le 14 octobre 2021, le hamster a été infecté par le nouveau coronavirus.

Le 22 décembre 2021, des hamsters importés sont arrivés dans les animaleries.

Le 4 janvier 2022, un membre du personnel d’une animalerie a été infecté par le nouveau coronavirus.

Un décalage horaire suffisant permet de déterminer l’ordre d’infection.

D'octobre à janvier de l'année suivante, la nouvelle souche de coronavirus a également muté, ce qui a entraîné certaines différences de mutation entre les souches de hamsters et de travailleurs de compagnie, bien qu'elles appartenaient à la même branche évolutive, de sorte qu'elles pouvaient être séparées.

05. Conclusion et conseils

Il s’agit de la première étude confirmant la transmission des animaux de compagnie aux humains. J’ai vu que de nombreuses personnes étaient insatisfaites de cette étude et certaines pensaient même qu’elle ne devrait pas être rapportée. Personnellement, je pense que c’est déraisonnable. En fait, que vous le voyiez ou non, le nouveau coronavirus est là, et il ne deviendra pas invulnérable simplement parce que nous nous armons mentalement.

De plus : Le nouveau coronavirus s’est avéré infectieux chez divers hôtes non humains :

Par exemple, les animaux de compagnie : chiens, chats, furets

Zoo : Chats et Gorilles

Élevage : Vison

Sauvage : Cerf de Virginie

Expérimental : Primates non humains, hamsters, furets, visons d'Amérique, chats, chiens viverrins, souris sylvestres d'Amérique du Nord, roussettes égyptiennes, loutres cendrées d'Asie et cerfs de Virginie

En fait, cette étude a également des implications pour notre prévention actuelle des épidémies :

1. Compte tenu du commerce transfrontalier fréquent d’animaux de compagnie, il est recommandé que les agences compétentes telles que les douanes prêtent attention au problème des animaux de compagnie infectés par le nouveau coronavirus.

2. Les propriétaires d’animaux doivent gérer leurs animaux dans une certaine mesure, en particulier ceux qui vivent à l’extérieur. Pendant l’épidémie, leurs activités doivent être limitées dans une certaine mesure pour éviter que le virus ne se propage à leurs propriétaires.

3. Les enfants aiment toucher les animaux de compagnie, ils doivent donc être protégés et désinfectés.

Quant aux attaques sur d’autres animaux de compagnie mentionnées par de nombreuses personnes, je pense personnellement qu’il n’y a pas suffisamment de preuves à l’heure actuelle.

Yen HL, Sit THC, Brackman CJ, Chuk SSY, Gu H, Tam KWS, Law PYT, Leung GM, Peiris M, Poon LLM ; Équipe d'étude HKU-SPH. Transmission du variant delta du SRAS-CoV-2 (AY.127) des hamsters de compagnie aux humains, conduisant à une transmission interhumaine : une étude de cas. Lancette. 12 mars 2022 ; 399(10329) : 1070-1078. est ce que je: 10.1016/S0140-6736(22)00326-9. PMID : 35279259 ; ID PMC : PMC8912929.