Répandez-vous plus rapidement ! Attention au « variant de deuxième génération » d’Omicron, car des cas sont apparus dans de nombreux pays

Répandez-vous plus rapidement ! Attention au « variant de deuxième génération » d’Omicron, car des cas sont apparus dans de nombreux pays

Récemment, une nouvelle variante de la souche Omicron numérotée « BA.2.75 » a attiré une grande attention de la part des scientifiques en Israël et dans d’autres pays. Cette variante a évolué à partir de la variante BA.2 de la souche Omicron et est appelée « variante de deuxième génération ». Il présente de nombreuses mutations « inhabituelles », qui peuvent briser la barrière immunitaire construite par les vaccins existants et les souches infectieuses, et il se propage rapidement. Des cas sont apparus dans de nombreux pays, notamment en Inde, au Japon et aux États-Unis. Les experts concernés craignent que cette variante puisse remplacer les variantes existantes telles que BA.2 et BA.4, et déclencher un nouveau pic de l'épidémie dans le monde.

De nouvelles mutations variantes suscitent des inquiétudes

Au 2 juillet, des chercheurs de différents pays ont trouvé 85 séquences génétiques du variant BA.2.75 dans les bases de données internationales sur le génome du coronavirus telles que « GISAID ». La variante est apparue pour la première fois dans des séquences génétiques provenant d'Inde début juin, puis est rapidement apparue dans sept autres pays, dont le Royaume-Uni, les États-Unis, le Japon, le Canada, l'Australie, la Nouvelle-Zélande et l'Allemagne. Étant donné que le nombre de génomes de coronavirus partagés par les pays ne représente que la pointe de l’iceberg du nombre de cas mondiaux de COVID-19, le nombre réel de personnes infectées par la variante BA.2.75 est bien supérieur à 85.

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Le Dr Shay Fleisch, expert au Laboratoire central des virus du ministère israélien de la Santé, a déclaré sur une plateforme de médias sociaux que l'émergence du BA.2.75 était « inquiétante ». Il s'agit d'une « variante de deuxième génération » issue de la variante BA.2. Par rapport à BA.2, il présente 16 nouvelles mutations, dont 8 sont localisées dans la région du gène de la protéine de pointe.

Le laboratoire américain Bloom a déclaré sur la plateforme de médias sociaux que par rapport à son BA.2, cette variante présente deux mutations clés, G446S et R493Q. Le G446S provoquera des changements dans les caractéristiques antigéniques, aidant le virus à franchir les barrières immunitaires construites par les vaccins existants, tandis que le R493Q augmente la capacité du virus à pénétrer dans les cellules humaines. Par conséquent, BA.2.75 mérite vraiment d’être suivi plus avant.

L'expert britannique en virologie Tom Peacock a déclaré que BA.2.75 présente un grand nombre de mutations de la protéine de pointe, appartient à la « variante de deuxième génération », a une vitesse de transmission rapide et une large distribution géographique, et doit être étroitement surveillé.

BA.2.75 pourrait devenir la première « variante de deuxième génération » à succès

Selon les explications de Shay Friesen, Tom Peacock et d'autres, la soi-disant « variante de deuxième génération » fait référence à une variante qui a évolué à partir de la « variante de première génération », mais qui présente davantage de mutations et est plus différente de la variante de première génération. Pour la souche Omicron, les variantes telles que BA.1, BA.2, BA.3, BA.4 et BA.5 sont des « variantes de première génération », tandis que BA.2.75 pourrait devenir la première « variante de deuxième génération » réussie.

Shay Fleisch a déclaré qu'avant BA.2.75, les chercheurs avaient découvert de nombreuses « variantes de deuxième génération » du nouveau coronavirus - « ces échantillons peuvent être trouvés tous les jours », mais les variantes découvertes auparavant ne s'étaient pas largement répandues et la taille de l'échantillon était très petite. BA.2.75 s'est répandu dans de nombreux pays différents et compte des dizaines d'échantillons. Il semble que cela ait été un succès. BA.2.75 n'est que la première « option réussie » et représente la « prochaine étape » dans l'évolution de la souche Omicron (c'est-à-dire la production de davantage de « variantes de deuxième génération »), et des changements génétiques plus complexes peuvent apparaître à l'avenir.

Tom Peacock a déclaré que les « variants de deuxième génération » ont évolué à partir de variants existants et réussis qui ont déjà une antigénicité, une transmissibilité et d'autres caractéristiques « désagréables », ce qui peut signifier qu'ils sont plus susceptibles d'acquérir des combinaisons de mutations plus menaçantes.

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De nouvelles épidémies pourraient survenir à l’avenir

Des études ont montré que la variante BA.2 de la souche Omicron est plus contagieuse que la variante BA.1 antérieure. À la fin de l’année dernière, après l’émergence de la souche Omicron, le variant BA.1 a déclenché pour la première fois un pic épidémique sans précédent dans le monde entier ; entre mars et avril de cette année, BA.2 a progressivement « remplacé » BA.1, provoquant l’entrée des États-Unis, de l’Europe et d’autres pays dans une nouvelle vague d’épidémie ; Après juin, la propagation des variants BA.4 et BA.5 a provoqué une nouvelle intensification de l'épidémie en Europe, en Israël et dans d'autres endroits.

De nombreux experts estiment que le BA.2.75 est susceptible de présenter un avantage concurrentiel par rapport aux autres variantes.

Mike Honey, expert australien en traitement de données, estime que le virus BA.2.75 se propage extrêmement rapidement. Entre le 15 et le 30 juin, la proportion de cette variante dans les échantillons de génome téléchargés par l'Inde est rapidement passée de moins de 5 % à 18 %, indiquant qu'elle remplace d'autres variantes et que sa propagation semble être plus rapide que les variantes BA.2 et BA.5.

Raj Rajnarayanan, professeur associé de biologie au New York Institute of Technology, estime également que BA.2.75 a le potentiel de remplacer BA.5, BA.4 et d'autres variantes BA.2 en propagation. Il existe actuellement trop peu de données pour tirer des résultats fiables, et son avantage en matière de croissance pourrait devenir apparent d’ici quelques semaines.

Tom Wenslers, professeur de biologie à l'Université de Louvain en Belgique, a également déclaré qu'il était certain que l'avantage de croissance de BA.2.75 par rapport à BA.5 était réel.

Ulrich Eling, chercheur à l'Institut de biotechnologie moléculaire de l'Académie autrichienne des sciences, a déclaré qu'avant de passer la vague BA.5, nous nous sommes peut-être déjà préparés pour la vague suivante. BA.2.75 et BA.5 présentent 11 mutations dans la région du gène de la protéine de pointe. La barrière immunitaire produite par l’infection par BA.5 pourrait ne pas être en mesure de protéger contre BA.2.75, ce qui entraînerait un nouveau pic d’infection.

Auteur : Hu Dingkun

Source : Science et Technologie Quotidien

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