Biotechnologie médicale | Décryptage de la nouvelle mutation du coronavirus : qu’est-ce qu’un « variant préoccupant » ? Comment prévenir le variant Omicron ? Voici tous les points clés !

Le nouveau coronavirus fait rage dans le monde entier depuis près de trois ans. Selon des statistiques incomplètes, le nombre cumulé mondial de cas confirmés du nouveau coronavirus a dépassé 580 millions et le nombre cumulé de décès a dépassé 6,4 millions, causant d'énormes pertes en vies humaines et en biens. La propagation continue et le rebond de l’épidémie du nouveau coronavirus sont principalement dus à la mutation continue du virus. Il est donc particulièrement nécessaire de comprendre les mutations et les principales variantes du nouveau coronavirus et de se familiariser avec les mesures de prévention et de contrôle.

Mutations du coronavirus

Des recherches pertinentes montrent que plus de milliers de nouveaux mutants du coronavirus ont été découverts dans le monde, et les mutations sont principalement des mutations ponctuelles, c'est-à-dire qu'un ou plusieurs nucléotides dans l'ADN du gène viral changent, provoquant la modification des acides aminés qu'ils codent, entraînant certaines caractéristiques du virus (telles que l'infectiosité, la pathogénicité, etc.) Changements.

Afin d’éviter les noms stigmatisants et discriminatoires des nouveaux variants du coronavirus, et également pour faciliter leur utilisation et leur mémorisation, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a annoncé le 31 mai 2021 l’utilisation de lettres grecques pour nommer les nouveaux variants du coronavirus. Selon les statistiques, plus de 10 nouveaux variants du coronavirus ont été nommés par l'OMS, à savoir : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Omicron, Lambda, μ, Epsilon, Eta, Lota, Kappa, Zeta et Theta.

Les « variants préoccupants » du nouveau coronavirus et leur classification

Les « variants préoccupants » du nouveau coronavirus font référence aux variants découverts lors de la surveillance qui peuvent entraîner une transmissibilité accrue, une virulence accrue, des changements dans la gravité de la maladie ou affecter les mesures de prévention et de contrôle existantes telles que les diagnostics, les médicaments thérapeutiques et les vaccins.

Les 10 aspects suivants sont utilisés pour déterminer le degré de préoccupation des variantes du virus :

(1) Si l’infectiosité augmente ;

(2) si le taux d’incidence a augmenté ;

(3) si le taux de létalité augmente ;

(4) si le taux de diagnostic est réduit ;

(5) Si la sensibilité aux médicaments antiviraux existants est réduite ;

(6) Si la sensibilité des anticorps neutralisants est réduite ;

(7) S’il est facile d’échapper à l’immunité du corps ;

(8) S’il est facile d’être à nouveau infecté ;

(9) s’il y a une augmentation des infections parmi les personnes vaccinées ;

(10) Si le taux d’infection augmente dans des régions et des populations particulières (comme les enfants et les personnes immunodéprimées).

En se référant aux normes ci-dessus et en fonction du niveau de risque des variants du virus, l'OMS divise les « variants préoccupants » du nouveau coronavirus en quatre catégories : les variants très préoccupants (VOHC : Variant Of High Concern) ; variants préoccupants (VOC : Variant Of Concern) ; variantes d'intérêt (VOI : Variant Of Interest) ; et les variantes qui nécessitent une observation/surveillance supplémentaire (VUI/VUM : Variante sous investigation/surveillance).

Grâce à l’évaluation des variants détectés, l’OMS a classé les nouveaux variants du coronavirus en VUI/VUM, VOI et VOC3. Il n'y a actuellement aucun VOHC. Le principe général de classification est le suivant : si la souche variante présente l’un des 10 points ci-dessus, elle est appelée VUI/VUM ou VOI ; s'il se propage au-delà d'une zone limitée, il est classé comme COV ; si l’effet de la souche variante sur l’intervention ou la prévention efficace est significativement réduit, elle est classée comme VOHC. Bien entendu, l’augmentation de l’infectiosité du virus, l’augmentation des taux de morbidité et de mortalité, et la diminution du taux de protection des individus vaccinés et de la sensibilité aux anticorps neutralisants sont autant de facteurs clés pour mesurer le niveau de préoccupation concernant les variants du virus.

Cinq « variants préoccupants » (VOC) nommés par l'OMS Actuellement, plus de 10 nouveaux variants du coronavirus ont été nommés par l'OMS, et cinq d'entre eux sont répertoriés comme « variants préoccupants » :

Alpha, Bêta, Gamma, Delta et Omicron.

1

Le variant Alpha, également connu sous le nom de lignée B.1.1.7 (en anglais : Lineage B.1.1.7), a été découvert pour la première fois au Royaume-Uni en septembre 2020. Parce qu'il possède plusieurs points de mutation clés, N501Y, P681H et H69-V70del, ce variant du virus a une très forte transmissibilité et des capacités d'infection très fortes, et est plus mortel et se propage plus rapidement que le nouveau coronavirus commun.

2

La variante bêta, également connue sous le nom de lignée B.1.351, a été découverte pour la première fois dans la zone métropolitaine de Nelson Mandela Bay, dans la province du Cap-Oriental en Afrique du Sud, en octobre 2020. En raison de la mutation E484K sur sa protéine de pointe, sa capacité à attaquer le corps humain en peu de temps est 3 à 5 fois supérieure à celle du nouveau coronavirus ordinaire, ce qui en fait une nouvelle variante de coronavirus hautement mortelle et à propagation rapide.

3

La variante gamma, également connue sous le nom de lignée P.1 (en anglais : Lineage P.1), a été découverte pour la première fois à Tokyo, au Japon, le 6 janvier 2021. Elle présente trois mutations spéciales : N501Y, E484K et K417T. Par conséquent, cette variante du virus présente une vitesse de transmission rapide, une forte capacité de destruction et une résistance élevée aux médicaments. Il n’existe actuellement aucun bon traitement contre cette variante du virus.

4

Le variant Delta, également connu sous le nom de lignée B.1.617.2 (en anglais : Lineage B.1.617.2), a été découvert pour la première fois en Inde à la fin de 2020. Ce variant du virus présente une transmissibilité, une pathogénicité et une capacité d'échappement immunitaire plus élevées. Il s’est propagé dans plus de 100 pays à travers le monde en très peu de temps, devenant la variante virale dominante de la pandémie mondiale de COVID-19 en 2021.

5

Le variant Omicron, également connu sous le nom de lignée B.1.1.529, a été découvert pour la première fois en République du Botswana, en Afrique australe, le 9 novembre 2021. Il s'agit du variant du coronavirus présentant le plus de points de mutation, le plus contagieux et le plus résistant au vaccin jusqu'à présent, et on estime qu'il réduit l'efficacité des vaccins actuels de 40 %.

Omicron fait des ravages dans le monde entier

À propos d'Omicron

Alors que la pandémie de COVID-19 entre dans sa troisième année, la variante Omicron a remplacé la variante Delta pour devenir la souche virale dominante qui influence le cours de la pandémie mondiale de COVID-19. C'est le variant le plus muté, le plus mutant et le plus contagieux à ce jour. Il existe plus de 10 sous-types d'Omicron qui ont été découverts dans le monde, notamment BA.1, BA.2, BA.3, BA.4, BA.5, etc. L'OMS a déclaré que les variantes dominantes de l'épidémie mondiale actuelle sont BA.4 et BA.5.

Caractéristiques épidémiques des variants d'Omicron

1

Plus de mutations Omicron est considérée comme la « souche la plus dangereuse » car 32 mutations ont été trouvées sur sa protéine de pointe (le Delta qui a balayé le monde n'en a que 16), ce qui est un nombre de mutations « sans précédent ». En particulier, les mutations sont localisées dans le domaine de liaison au récepteur (RBD), où Omicron présente au moins 10 mutations (2 en Delta et 3 en Beta).

2

Des études sur la capacité d’échappement immunitaire améliorée ont révélé que les mutations K417N, G446S, E484A et Q493R sur la protéine de pointe Omicron étaient impliquées dans l’échappement immunitaire. Ces mutations renforcent l'affinité entre le virus et le récepteur cellulaire humain ACE2, inhibant ainsi de manière compétitive la liaison des anticorps neutralisants à la protéine de pointe (S), permettant au virus d'échapper à la défense immunitaire et d'éviter la détection et l'attaque par le système immunitaire.

3

Plus transmissible Des études montrent qu'Omicron BA.1 se propage 77 % plus vite que Delta. Le BA.2, qui est populaire dans mon pays, se propage 66 % plus vite que le BA.1. Il a également été constaté que par rapport à la transmissibilité de la souche d'origine (R0 = 3), la transmissibilité de Delta (R0 = 7) a augmenté de 2 à 3 fois. Chez Omicron, la transmissibilité (R0=10) a été encore améliorée, soit 1,4 fois celle de Delta et 3,3 fois celle de la souche originale.

4

La durée des symptômes devient plus courte. Bien que le nouveau coronavirus ait produit de nombreuses souches mutantes par mutation, les symptômes causés par l’infection sont fondamentalement similaires. Les données cliniques montrent que les patients infectés par Omicron présentent des symptômes cliniques d’une durée plus courte et récupèrent plus rapidement. Selon les statistiques, la durée moyenne des symptômes cliniques chez les patients infectés par Delta était d'environ 8,9 jours (personnes vaccinées) et 9,6 jours (personnes non vaccinées), tandis que la durée des symptômes chez les patients infectés par Omicron était significativement plus courte, soit 6,9 jours (personnes vaccinées) et 8,3 jours (personnes non vaccinées).

5

La baisse des taux de maladie grave et de mortalité montre que plus de deux ans se sont écoulés depuis l’apparition du nouveau coronavirus. Le virus a subi de nombreuses mutations et sa capacité à se propager augmente constamment, mais sa capacité à tuer l’hôte s’affaiblit. À en juger par les cas actuels d’infection à Omicron dans le monde, la plupart sont des cas bénins, et le taux d’infection grave et le taux de mortalité ont diminué.

Il convient de noter que même si Omicron n’a peut-être pas des taux de gravité et de mortalité aussi élevés que d’autres variantes, il s’agit toujours d’un virus mortel. Comme l'a déclaré le Dr Tedros Adhanom Ghebreyesus, directeur général de l'OMS, lors d'une conférence de presse : « Bien que l'Omicron semble être moins grave que le Delta, en particulier chez les personnes vaccinées, cela ne signifie pas qu'il doit être classé comme bénin. »

Accélérer la vaccination et construire des barrières immunitaires

Des études connexes ont montré que même si les multiples mutations du variant Omicron augmentent le risque d’échappement immunitaire, celui-ci n’échappe pas complètement aux vaccins existants. Le fait de terminer le cycle complet de vaccination peut encore réduire efficacement le risque d’hospitalisation, de maladie grave et de décès causé par le variant Omicron. Par conséquent, les vaccins existants ont toujours un certain effet protecteur contre le variant Omicron, et la vaccination active reste la mesure préventive la plus efficace.

Adhérer à la stratégie générale de « prévention des importations de l'extérieur et de rebond de l'intérieur » et à la politique générale de « réduction à zéro dynamique »

À l’heure actuelle, l’épidémie mondiale de COVID-19 est toujours à un niveau élevé, et la Corée du Sud et le Vietnam, pays voisins de mon pays, sont également devenus les pays avec le plus grand nombre de nouveaux cas signalés par jour au monde. En outre, l’émergence d’Omicron BA.5, qui est plus contagieux et est devenu la principale souche épidémique mondiale, a accru la pression sur mon pays pour « prévenir les cas importés de l’étranger ». En outre, l’épidémie locale causée par le variant Omicron s’est également propagée dans de nombreuses provinces et villes de mon pays. L'épidémie nationale est caractérisée par de multiples points, une large couverture et des occurrences fréquentes, et la situation épidémique est grave.

Par conséquent, afin de prévenir efficacement une épidémie à grande échelle, de minimiser la propagation et le taux de mortalité et d'éviter la perte de davantage de vies, notre pays doit toujours adhérer à la stratégie générale de « prévention des cas importés de l'extérieur et de rebond de l'intérieur », et continuer à adhérer à la politique générale de « zéro dynamique » sans hésiter ni se relâcher.

Augmenter l’intensité des tests d’acide nucléique et renforcer la gestion des tests d’acide nucléique réguliers

Les tests d’acide nucléique sont un moyen essentiel pour découvrir rapidement la source de l’infection, verrouiller les cibles de contrôle, puis prendre des mesures d’isolement et d’autres mesures pour couper les voies de transmission. Il a joué un rôle important dans la gestion réussie des épidémies groupées dans mon pays.

À l’heure actuelle, la prévention et le contrôle de l’épidémie dans mon pays sont entrés dans une nouvelle phase de réponse à la propagation du variant Omicron. La variante Omicron présente les caractéristiques d’une transmission plus rapide, d’une période d’incubation plus courte et d’une plus grande dissimulation. Ces caractéristiques rendent certaines personnes infectées précocement difficiles à détecter, ce qui entraîne une propagation rapide du virus sur une courte période de temps. Dans cette situation, nous devons réagir rapidement, effectuer des tests d’acide nucléique dès que possible, dépister les infections positives et prendre des mesures de contrôle efficaces pour couper la chaîne de transmission du virus de manière opportune et efficace et obtenir le plus grand effet de prévention et de contrôle au moindre coût. Il est donc indispensable de continuer à effectuer plusieurs séries de tests d’acide nucléique dans les zones épidémiques et d’effectuer régulièrement des tests d’acide nucléique dans les zones épidémiques.

Adoptez une bonne protection personnelle et gardez à l'esprit les « quatre mesures majeures » et les « huit points d'attention »

« Quatre mesures majeures » : porter un masque, se laver les mains fréquemment, aérer fréquemment et se rassembler moins.

« Huit points d’attention » : Premièrement, réduire le flux de personnes et réduire les foules ; deuxièmement, ne partez pas à l’étranger, ne vous rassemblez pas en groupe et ne vous rendez pas dans des zones à risque moyen ou élevé ; troisièmement, sortez en dehors des heures de pointe et maintenez une distance d’un mètre ; quatrièmement, rendez visite moins souvent à vos proches et amis, ne faites pas d’accolades et ne serrez pas la main ; cinquièmement, réduire les rassemblements familiaux et prôner des repas séparés et des baguettes publiques ; sixièmement, choisissez les attractions populaires avec prudence et il est préférable d’acheter des billets en ligne ; septièmement, les patients fiévreux sont dans un état critique et doivent être vus dans des cliniques externes spécialisées ; huitièmement, réduisez les visites aux voisins et signalez rapidement les risques au personnel.

Auteur : Yaohuluwa Medical Biology Science Popularization Group